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Reg. Tribunale Lecce n. 662 del 01.07.1997
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ERA POST GENOMICA

La frontiera produttiva dell' invisibile la: NANO-BIO-ELETTRONICA .

 

“Prima Parte introduttiva:  presentata a Napoli il 20 /OTT/ 2006 ” .

 

Di : Paolo Manzelli <pmanzelli@gmail.com>

 

 

                    Conoscere il passato per progettare il futuro e un detto che prevede una continuita' del sapere ormai illusoria. Le vecchie concezioni lasciano oggigiorno rapidamente il passo a nuove scoperte e nuove teorie che modificano profondamente  modelli cognitivi della scienza e della cultura moderna.

 

Il sequenziamento del genoma umano ottenuto dalla Celera-Genomics nel 2003 , ha definitivamente aperto una profonda rivoluzione nella comprensione nelle "scienze della vita" . Il paragone tra la lunghezza del genoma umano, con quello dei corredi genetici di esseri viventi assai meno evoluti, ha messo in evidenza che la sequenza dei ribonucleotidi nel DNA e’ assai minore nell' uomo che non ad es. negli anfibi e nei rettili . Quindi  non e piu’ possibile associare la lunghezza del genoma alla evoluzione della complessita' che caratterizza la evoluzione di un organismo vivente. Inoltre la similarita' delle sequenze genomiche di specie altamente diverse quelle tra l' uomo , il moscerino delle frutta,  non permette piu’ di considerare il DNA come il detentore  unico dei caratteri di informazione che sono necessari ma non sufficienti per determinante la bio-diversita' nell' albero della evoluzione della vita. 

 

Recenti studi hanno messo in evidenza che la percentuale del DNA destinata a codificare le proteine e' estremamente ridotta, mentre la

quantita' della Molecola di RNA (trascrittoma) , a cui e’ stato attribuito il compito di trascrivere l' informazione genetica , e' enormemente piu' elevata, cosi che il complesso delle molecole di RNA e stato chiamato RNA-WORD. In particolare il RNA –Ribosomatico rappresenta 80% del RNA cellulare e la sua funzionalita'  nell' assemblare e regolare la composizione delle proteine, non e stata ancora completamene chiarita. Inoltre alcune sezioni di RNA , possono reintegrarsi nel DNA mutando reversibilmente la propria composizione.

 

Quindi diventa comprensibile il perche' ci sia cosi poca differenza del patrimonio genetico tra esseri viventi cosi distanti nell' albero della vita;  infatti non sono soltanto le sequenze codificanti finalizzate a produrre proteine a fare la differenza evolutiva , ma l’ intero  sistema di regolazione che governa la differenziazione della informazione biologica .

 

Le proteine stesse sono responsabili di molteplici processi di sviluppo del regolamento metabolico delle informazione biochimica circolante in una cellula. La funzionalita di una proteina infatti non dipende esclusivamente dalla successione degli amminoacidi codificata dalla azione di trascrizione di sezioni del “DNA-CODIFICANTE” (che e’  circa il 2% del Totale) ,  ne' dalla  successiva azione di traduzione dei vari RNA-World , la quale in ultima analisi genera il polipeptide proteico lineare . Infatti la funzionalita' dei patterns attivi di ciascuna proteina  dipende dal ripiegamento tridimensionale (Folding) ,proprio in quanto questa puntuale organizzazione tridimensionale delle proteine ,  genera la  organizzazione funzionale di domini proteici distinti, con modalita' deit tutto  indipendenti dalla codificazione indotta dal materiale genetico. Il  controllo del “ Folding” strutturale delle proteine e’ affidato ad altre proteine con azione enzimatica (Operoni) del tipo  Chapeiron ( accompagnatore), le quali controllano anche la stabilita proteica, in funzione della  particolare scadenza temporale di sviluppo del metabolismo cellulare. Lo studio delle funzionalita’ proteiche nella regolazione dei flussi di informazione cellulare, capaci di assolvere alla varie funzioni vitali di ogni cellula , e stato chiamato "Proteomica" (prendendo a modello la parola Gnomica).

 

Ma c’e’di piu’:   intere Sequenze di DNA possono essere trasposte in senso diretto ( Trasposoni ) ed inverso (Retroposoni) , ed e’ stato calcolato che nel genoma umano circa il 45% e’ composto da tali sequenze mobili dette,  LINE , SINE a seconda che gli elementi nucleari intessersi siano Lunghi (Long) o corti (Short) . Tali trasposizioni possono modificare riarrangiamenti del DNA, che avvengono  piu’ spesso nelle sezioni  considerate “non-codificanti” ( ovvero: Junk –DNA) . tali trasposizioni  sono ottenute  sia per spostamento delle sequenze nucleotidiche nello stesso Cromosoma , ovvero per ricombinazione tra frequenze omologhe tra i cromosomi paralleli degli organismi diploidi ( “ Cross –Over”  tra i doppi cromosomi contenuti nel nucleo delle cellule eucariotiche) .

 

Pertanto nell’ ERA POST GENOMICA, osservando la dinamica dei processi di informazione biologica della intera cellula , dove neppure la sequenza del DNA non e’ piu’  statica, essendo variamente ricomponibile , ci assilla piu’ di un dubbio sulle conoscenze acquisite , cio’ perche’ non e’ evidentemente  piu’ possibile considerare che  gran parte del “DNA non-codificante” sia ancora da considerarsi  “spazzatura fossile“.

 

 

 

Didascalia della FIGURA :

1)- Replicazione DNA; 2)- Trascrizione RNA; 3)- Traduzione RNA-Ribosomatico; 4)- Trasposizione DNA;

5) - Reintegrazione RNA; 6) - Folding PROTEICO; 7) - Ciclo: Bio-informazione- Proteina ßàDNA.

 

Un modello teorico di “hopping” dei segnali di comunicazione cellulare.

  “Cenni su DNA e  la NANO-BIOELETTRONICA”

 

                    Quindi per rimettere le conoscenze biologiche nella giusta prospettiva dell' Era Post-Genomica e favorire una nuova presa di coscienza sulle “scienze della vita”,  bisogna innanzitutto riconoscere che la trattazione fino a oggi condivisa dalla scienza  biologica , e' stata troppo simile a quella di un sistema di produzione di proteine , visto attraverso un modello meccanico di una catena di montaggio di una tipografia.

                    L' abbandono di tale modello biologico-meccanico , ormai in gran parte obsoleto , e' quanto e’  proposto dall' OPEN NETWORK for NEW SCIENCE, al fine di proporre un metodo di “Hopping” ( letteralmente : saltellamento) della comunicazione modulata di segnali “fononici” trasmessi nelle bande di frequenza vibrazionale trasmissibili in un ambiente cellulare, con modalita’   capaci di evitare per risonanza la alterazione (noise)  dei messaggi in un sistema a larga banda di bio-frequenze.

 

Nel vecchio paradigma delle Scienze Biologiche,  il DNA e' stato visto  come un sistema parzialmente indirizzato alla codificazione delle Proteine, ma in tal modo non si e’ presa in considerazione la questione decisiva di come le  attivita’ di produzione protetica dovevano essere coordinate da un sistema di sequenziamento temporale assai preciso e puntuale.

 

                    Pertanto nel “Nuovo Paradigma delle Scienze della Vita” , diviene necessario ammettere che il sistema di codificazione genetica del materiale proteico debba  essere  inteso come complementare ad una nuova funzione del DNA. Quest’ ultima  puo’ essere concepita come un sistema "bioelettronico in scala nanometrica " capace di coordinare il metabolismo cellulare mediante la emissione a distanza di ” bio-fononi” , cosi da poter   comunicare e regolare la informazione biologica di ogni  cellula in un sistema vivente.

 

In tal modo il DNA invece di essere considerato in gran parte come JUNK-DNA -(DNA-Spazzatura ) in tutta la sua inutile lunghezza, viene altresi’ ad avere una complementare funzione bio-elettronica , capace di regolare il sistema dinamico della circolazione delle informazione biologica nelle cellula.

 

Il DNA quindi in base a tale modello teorico , non e piu’ visto soltanto come la banca dati per la  CODIFICAZIONE materiale delle sequenze Proteiche, ma anche come un sistema di comunicazione e coordinamento della bio-informazione, cio e conseguenza diretta del fatto che ormai sappiamo che per eseguire la   funzionalita’  di conservazione e riproduzione  del codice genetico e' con ogni evidenza  necessaria,  soltanto  una piccola porzione del DNA codificante per proteine.

 

Per capire la funzionalità di comunicazione a distanza del metabolismo cellulare, la struttura a doppia elica del DNA puo’ essere considerata come una “ ANTENNA  RICE-TRASMITTENTE” capace di regolare , come sistema di controllo a piu’ livelli di frequenza, tutto il ciclo temporale di informazione cellulare . Probabilmente e’ proprio per avere una "duplice rete di sicurezza" nel caso che il controllo temporale fallisca , che gli organismi Eucarioti sono Diploidi .

 

Infatti osserviamo, gia’ dalle REAZIONI dell’ OROLOGIO ( CLOCK reactions), studiate per semplificare il Ciclo di Krebs , quale sia la importanza  della regolazione temporale nella trasformazione molecolare di sistemi chimici dissipativi di calore.

 

Pertanto il modello del “DNA –ANTENNA” rende possibile comprendere come sia possibile regolare a  distanza l'attività degli enzimi ed di altri prodotti intermedi del metabolismo (metaboliti) attivandoli ovvero , disattivandoli , mediante reazioni basate sulla reattivita’ dei “bio-fononi”.

 

Varie sono infatti le possibili modalita’ di ricezione dei “segnali fononici”: infatti i siti attivi proteici, possono essere considerati come cavita’ ovvero membrane risonanti, capaci di attuare delle modificazioni strutturali dei siti attivi, che tramite un sistema di Hopping ad interferenza mininale , riescono ad attuare un completo sequenziamento  temporale del metabolismo cellulare a seconda delle esigenze di continuo rinnovo  proteico del sistema vivente.

 

Volendo approfondire questa importante questione del “DNA-Antenna” , e’ innanzitutto  necessario comprendere che la biologia, come disciplina a se stante, si e’ limitata a descrivere come fosse possibile, mediante il codice genetico, riuscire a produrre il rinnovamento proteico durante il ciclo metabolico di una cellula.

 

Perseguendo tale primario obiettivo la descrizione biologica ha pero’ perso di vista come il DNA dovesse avere la funzione di regolazione temporale del circuito di informazione cellulare.

Pertanto la impostazione disciplinare della biologia  deve oggi assumere un ruolo trandisciplinare per capire alcuni elementi di elettrochimica molecolare relativi alla proprietà della doppia elica del  DNA,  quest’ ultima  vista in qualità di una complessa nano-struttura di guida per la emissione di “Fononi” vibrazionali . ( cioe di quegli  elementi di comunicazione acustica , corrispondenti alle particelle di frequenza ottica detti “Fotoni” ).

 

Sappiamo che le proprietà di conduzione elettronica  del DNA sono isolanti ; cio’ e vero finche il DNA e’ statico; infatti la molecola di  DNA e strutturata come  un doppio polimero le cui polarita’, in seguito alla sovrapposizione degli orbitali elettronici ,  vengono ad annullarsi reciprocamente nella struttura a doppia elica in seguito ad un fenomeno di resistenza diretta ed inversa.

 

La conducibilità elettronica del DNA viceversa cambia rapidamente (coinvolgendo, tutta la struttura del DNA), quando esso viene aperto e richiuso , per duplicazione , o per trasposizione di sequenze nucleotidiche.  In tal caso la rottura dei legami a “ponte di H” corrisponde ad un effetto perturbativo capace di generare  la emissione di segnali fononici, come conseguenza della polarizzazione dovuta all’ allargamento della banda di conduzione.  Tale emissione di onde vibrazionali determina una ritmica emissione di microonde vibrazionali,  come  conseguenza del fatto che la separazione  delle coppie di base (AT = Adenina-Timina)  provoca un polarizzazione di scissione della doppia elica relativa alla rottura di “due” ponti ad Idrogeno , mentre la separazione della altre due basi (CG = Citosina- Guanina), determina la frammentazione di “tre” legami a idrogeno provocando una emissione fotonica di diversa ampiezza. Inoltre la densita’ variabile di successione  delle coppie (AT) e (CG )  lungo la struttura del DNA, determina una precisa modulazione  del segnale vibrazionale il cui spettro viene recepito da opportuni siti attivi del RNA e dei Metabolici enzimatici ed altre proteine con funzionalita biologica rilevante nel metabolismo proteico. Il sistema di HOPPING  in una larga banda di frequenze e’ reso sincrono dal duplice controllo proprio  delle cellule “diploidi” o “multiploidi”. In ogni caso anche nei sistemi “apolidi” propri  delle cellule Procariote, il sistema cellulare realizza una propria disposizione alla ricezione di fequenze fononichje , in modo tale tale da reagire all’ impulso generato dalle onde vibrazionali emesse dal del DNA al fine di  modificare  la dinamica  metabolica della cellula struttura in modo coerente ed interattivo con  informazione genetica ricevuta dal  “DNA-ANTENNA”.  

 

In tal guisa la sincronizzazione temporale degli eventi metabolici puo’ essere compresa in termini di una successione di eventi di comunicazione non casuali ma coordinati e sincronizzati nel tempo e nello spazio della dinamica di interazione della bio-informazione propria delle  attivita’ metaboliche di ogni cellula vivente.

 

                    Di questa nuova opzione scientifica sul funzionamento “nano-bioelettronico del DNA ne parleremo piu ‘ approfonditamente durante il SEMINARIO 13-NOV-2006 FIRENZE in PALAZZO STROZZI ;ore 9.00 - 18.00 ;  cio ci permettera’ di comprendere come lo sviluppo attuale delle cognizioni biologiche potra’ anche superare ogni precedente sperimentazione relativa alla produzione di Organismi Geneticamente Modificati , (O.G.M),  proprio al fine di dare sviluppo ad una nuova ed importante produzione di Organismi Biologicamente Avanzati ( in sigla O.B.A).

 

(vedi   : http://www.egocreanet.it ) BIBLIO ON LINE : O.B.A ;  http://www.edscuola.it/archivio/lre/oba.htm; FOOD PROJECT AMETISTA ; http://www.edscuola.it/archivio/lre/ametista.htm; Bio-informazione ; http://www.edscuola.it/archivio/lre/alu.htm ; Tempo di catalisi : http://www.edscuola.it/archivio/lre/tempo_di_catalisi.htm

 

 

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INFORMAZIONI PRELIMINARI SUL SEMINARIO di STUDI UNIVERSITA’ IMPRESA del progetto “INN-OVATION”

 

La Associazone EGOCREANET -OPEN NETWORK FOR NEW SCIENCE , > <http://www.EGOCRENE.IT>organizza a Firenze in data 13 NON 2006 , il  SEMINARIO sul tema:

 <FOOD for LIFE : CONSUMER SCIENCE INNOVATION >

http://www.mapbraincommunication.com/005432.asp

 

in collaborazione con la "FEDEALIMENTARI" ed il "CeRA" della Universita di  Firenze e di "MAP BRAIN" in Prato.

Al SEMINARIO in Palazzo Strozzi presso il VIEUSSEUX predisposto in previsione dei Bandi EUROPEI del 7/PQ  su “FOOD , AGRICULTURE & BIO-TECHNOLOGY” si dicutera' :

a) Delle strategie di INN-OVATION della Formazione della  Cultura  Scientifica e Nutrizionale  dei consumatori per la salvaguardia della  salute e del benessere.

b)  Della NUOVA AGRICOLTURA di PRECISIONE nella ECONOMIA della  CONOSCENZA e delle FRONTIERE DELLA PRODUZIONE DELL' INVISIBILE  trattando degli  Organismi Biologicalemte Avanzati (OBA) .

c) Dei modelli cognitivi e tecnologici che, sulla base delle "Mappe  Cerebali "  e di Tecnologie Intelligenti (RFID), nell' insieme  sono necessari per ri-orientare e ri-organizzare la Governance  dell'  Alimentazione nella produzione e consumo ,  quale priorita’ di sviluppo e quindi per favorire la  condivisione ed il consenso dell' sviluppo scientifico e tecnologico  piu' appropriato alla crescita della  Societa Europea della  Conoscenza.

 

Maggior inforazioni vanno richieste a :

Paolo Manzelli : pmanzelli@gmail.com

Roberto Cei : robertocei@libero.it


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